Die FOGS GmbH wurde im Jahr 1988 als unabhängiges Institut von Professor Dr. Rudolf Schmid gegründet. Im Juli 2022 wurden die Gesellschaftsanteile an die Johanneswerk gGmbh, Bielefeld übertragen, mit der gemeinsam die fachliche Ausrichtung des Instituts weiterentwickelt wird. FOGS ist seit seiner Gründung in Köln ansässig und wurde bis 2024 gemeinschaftlich von Hans Oliva und Martina Schu in der Geschäftsführung geleitet. Geschäftsführung und Institutsleitung liegen seit Oktober 2024 bei Prof. Dr. Nicole Stollenwerk und Miriam Martin.
Die FOGS GmbH verfügt derzeit über 21 Beschäftigte und einen Kreis freier Fachkräfte, mit denen projektspezifische Kooperationen eingegangen werden. Im FOGS-Team sind Mitarbeitende unterschiedlicher Fachdisziplinen vertreten, insbesondere Sozialwissenschaften/Soziologie, Pädagogik, Politologie und Psychologie.